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RNAi穩轉株構建服務
時間:2016-05-11     作者:懋康生物    
 服務描述
shRNA穩轉株是指能持續穩定表達干擾特定基因shRNA的細胞。RNA干擾是基因功能研究中最常用的手段之一。懋康生物利用慢病毒將shRNA序列整合入細胞基因組,并通過慢病毒載體攜帶的抗性基因(通常為新霉素,嘌呤霉素,潮霉素)篩選出穩定轉染shRNA的細胞,使其成為shRNA穩定轉染細胞系。

 服務內容
1:shRNA干擾靶點序列的設計;
2:shRNA 慢病毒質粒的構建;
3:shRNA慢病毒包裝與病毒滴度測定;
4::病毒感染靶細胞并從RNA水平(Real-time PCR)和/或蛋白水平(Western Blot)驗證干擾效果; 
5:選出干擾效果最好的細胞,利用慢病毒載體攜帶的抗性基因篩選建立穩定細胞系;

 服務說明
1:我們的RNA干擾服務針對所有的哺乳動物細胞,暫不提供植物和原核生物的RNA干擾服務;
 2:RNA干擾的對象可以是編碼蛋白的mRNA序列,也可以是長的非編碼RNA(lncRNA)序列;
3:針對不同的靶基因,我們一般設計3-4條干擾序列,保證至少有一條序列干擾效果大于70%(RNA水平);
4:我們提供多個慢病毒干擾載體供客戶選擇(見下方載體信息);
5:對于干擾效果的驗證,客戶可以選擇只從RNA水平(或蛋白水平)進行驗證,也可選擇兩個水平都進行驗證(lncRNA無法從蛋白水平驗證);
6:靶細胞和Western Blot 實驗需要的一抗由客戶提供,也可委托我公司代購;
7:Real-time PCR采用SYBR Green 法 三復孔進行干擾效果驗證,確保實驗結果真實可信;

客戶所得
1:構建好的慢病毒干擾質粒,剩余病毒及穩轉株細胞;
2:完整的實驗報告(包括實驗材料,實驗步驟,實驗結果等)及慢病毒使用操作說明書一份;

 服務周期
從靶點設計到穩轉株完成總共需要45個工作日;

 載體信息

載體編號

篩選標記

載體骨架主要元件

熒光

真核抗性

pHY-LV-KD1.1

GFP

U6-shRNA-CMV-GFP

pHY-LV-KD1.2

RFP

U6-shRNA-CMV-RFP

pHY-LV-KD1.4

Puromycin

U6-shRNA-CMV-Puromycin

pHY-LV-KD2.1

GFP

U6-shRNA-EF1α-GFP

pHY-LV-KD3.1

GFP

U6-shRNA-UBC-GFP

pHY-LV-KD5.1

GFP

Puromycin

U6-shRNA-CMV-GFP-PGK- Puromycin

pHY-LV-KD5.2

RFP

Puromycin

U6-shRNA-CMV-RFP-PGK- Puromycin

pHY-LV-KD5.4

GFP

Puromycin

U6-shRNA-UBC-GFP-PGK- Puromycin

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